其林貝爾VDRTEX?5在發(fā)育樹(shù)構(gòu)建的使用

1 材料與方法

VITEK?2 Compact 全自動(dòng)微生物鑒定儀及配 套 鑒 定 卡 、VITEK MS ? DS 靶 板 和 VITEK MS ? CHCA 基質(zhì)液均購(gòu)自法國(guó)梅里埃公司；CO2培養(yǎng)箱 為美國(guó) Thermo 公司產(chǎn)品；旋渦混合器 VDRTEX?5 購(gòu)自海門其林貝爾儀器制造有限公司；細(xì)菌基因 組 DNA 快速抽提試劑盒購(gòu)自生工生物工程（上 海）股份有限公司；PCR 擴(kuò)增儀購(gòu)自美國(guó) PE 公司； 電泳儀購(gòu)自美國(guó) Tanon 公司；紫外凝膠成像儀購(gòu)自 上海復(fù)日生物技術(shù)有限公司。

2 結(jié)果

通過(guò)對(duì) HlyA、HlyB、HlyC、HlyD 基因的擴(kuò)增， HlyB 為陽(yáng)性，其余均為陰性。測(cè)序結(jié)果顯示檢出 的 HlyB 與病原菌毒力因子（Virulence Factors of Pathogenic Bacteria，VFDB）數(shù)據(jù)庫(kù)中 HlyB 有 99% 同源性。使 用 Blast 將 菌 株（標(biāo) 本 編 號(hào) ：U1901）的16SrDNA 序列與 NCBI 的 16S 數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)后 發(fā)現(xiàn)在該系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)上可見(jiàn)，U1901 與摩根摩根菌 摩根亞種 NBRC 3848 形成一個(gè)分支，驗(yàn)證可信度 達(dá) 99.99%。

3 討論 

近幾年，隨著社會(huì)環(huán)境和醫(yī)療技術(shù)水平的逐 漸改變，摩根摩根菌的感染部位和檢出率在不斷 增加 。由 ICU 患者所處的情況可知，本研究中 的摩根摩根菌是在眾多因素作用壓力下存活繁 殖，其毒力和耐藥率較高。

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